线粒体内膜蛋白质要多于外膜,主要是因为内膜它的通透性是比较差的,但是它的面积却要比外膜更大一些。线粒体的外膜是比较平滑的,上面含有的呼吸酶是比较少的,基本上是不含有的,而线粒体的内膜却有很多的脊,所以它的面积比较大,含有的酶也比较多,而这些酶在有氧呼吸中是发挥着重要的作用的。再者建立体的内膜通透性较差,上面有ATP合成酶复合体,也就是当没通过了这些通道之后,就会产生较多的ATP,这一特点是外膜所没有的。内膜上所存在的酶以及质子通道的结构基础其实都是蛋白质,因此线粒体内膜蛋白质要比外膜更多。
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